一般而言，两种检查井在结构上都是相同的。首先，它们都需要抹面。不同的是，污水检查井是需要内外抹面的，而雨水只需要内抹面。另外，污水井的流槽是0.85倍管径，雨水要小。不过有的为了能够省下一些工序，在做雨水检查井的时候，只是在地下水位以下时才要抹面。这点主要考虑的是雨水会漏水，外面砖与土体保证一体处理，可以保证内面粉刷不脱落。不过这些竣工后都不容易辨别，所以还是看看井内的水量，井盖，还有鼻子闻闻。
如果不按照具体的要求进行抹面处理，会造成井内水源外渗，从而造成水质污染。反之，如果地下水位高的情况下，则地下水会渗入井内，从而增加污水处理厂处理的污水总量，而其收益并未提高（污水收费是一般是按用水量乘一定系数收的）。